旋风除尘器的结构型式，取决于含尘气体的入口型式和除尘器内部的流动状态。按照结构型式可以分为圆筒体、长锥体、旁通式和扩散式等；按气体流动状况可以分为切向反转式旋风除尘器，轴向式旋转除尘器。
旋风除尘器的入口型式对于改良除尘器性能，减小压力损失有规定的影响。气体入口型式一般分为两种。进气方向大致与除尘器轴线垂直，与筒体表面相切进入。含尘气体进入后，在筒体部分旋转向下，进入锥体到达锥体前，反转向上，清洁气体经排气管引出。这是常见的切向返转式旋风除尘器。进气方向与除尘器轴线平行的，称之为轴向式旋风除尘器。该除尘器利用导流叶片，使含尘气体在除尘器内旋转。其除尘效率比前者低，但处理量大。
切向返转式旋风除尘器又分为直入式和蜗壳式。直入式入口管外壁与除尘器筒体相切；而蜗壳式入口管内壁与除尘器筒体相切。入口管外壁采用渐开线形式，渐开角为180°，270°及360°等。直入式进口设计与制造方便，性能稳定。蜗壳式入口增大进口面积容易，并因入口有一个环状空间，使入口含尘气流距离筒体外壁更近。这样，即缩短了尘粒向筒壁沉降距离，又可减小入口气流与内旋流间的相互干扰，对提高除尘器效率有利，但却使除尘器体积有所增大。切向式入口的旋风除尘器，压力损失约为1000Pa左右。
轴向式旋风除尘器，根据含尘气体在除尘器内流动方式可分为直流式、反旋式两类。轴向进入型式的除尘器，气体旋转时利用导流叶片进行的，叶片形状有各种形式。与切向进入型相比，在同一压力损失下，能处理三倍气体量，且气流分配均匀。因而主要用其组合成多管旋风除尘器，处理量大的含尘气体，轴向进入式除尘器的压力损失约为400-500Pa，除尘效率也较低。